Shugo Chara! – Amu Hinamori adalah siswa di Seiyo Elementary, di mana ia memiliki reputasi sebagai “keren dan pedas”; namun, kepribadiannya yang sebenarnya adalah gadis yang sangat pemalu dan mudah diintimidasi. Suatu malam Amu berharap dia akan berani dilahirkan kembali sebagai “calon” dirinya. Keesokan paginya Amu menemukan tiga telur berwarna cerah — merah, biru, dan hijau — di ranjangnya. Setiap telur akhirnya menetas menjadi Karakter Guardian: Ran, Miki, dan Su. Karakter Guardian adalah makhluk seperti malaikat yang membantu seseorang untuk menjadi “calon” mereka dan memenuhi impian orang tersebut. Karakter Guardian mencapai ini dengan memberikan dorongan dan saran, tetapi mereka juga dapat sementara mengubah kepribadian dan kemampuan seseorang. Dengan Karakter Guardian, kehidupan Amu menjadi jauh lebih kompleks karena dia sekarang berjuang untuk berurusan dengan kepribadian barunya dan Seiyo Elementary Guardians — kelompok dewan siswa di mana setiap anggota memiliki Karakter Guardian mereka sendiri — yang merekrut Amu untuk mencari dan menyegel X telur dan Karakter X, bentuk rusak mimpi orang.