Koi wa Deep ni – Nagisa Mio, seorang ahli kelautan di Shibaura University of Marine Science and Technology, sangat tertarik dengan ikan dan menyukai laut. Meskipun senyumnya ceria dan baik hati, kepribadiannya baik hati, dia pendiam tentang keluarga dan masa lalunya. Hasuda Rintaro, putra kedua dari keluarga kaya raya, ditakuti oleh orang-orang di sekitarnya karena ia tampil sebagai sosok yang sulit didekati. Tapi di balik baju besi itu ada seorang pria muda dengan hati yang murni dan tanpa basa-basi. Ketika dia kembali ke Jepang karena kesehatan ayahnya yang buruk, dia ditugaskan pada proyek pengembangan kelautan. Meskipun Mio ingin melindungi laut dan menentang pembangunan resor, Rintaro mempertaruhkan nyawanya untuk hal tersebut. Kedua orang ini seolah-olah hidup di dunia yang berbeda, bertemu satu sama lain dalam suatu proyek dan akhirnya jatuh cinta. Namun, kisah cinta mereka terlarang karena Mio mempunyai rahasia yang akan mengejutkan semua orang.